目前，國外已經有十多家從事DNA 芯片研究的公司，他們的芯片技術雖然各具特色，應用目的也不盡相同。但要成為實驗室研究或可以普遍采用的技術仍有一些關鍵問題亟待解決

（1）提高基因芯片的特異性；

（2）簡化樣品制備和標記操作；

（3）增加信號檢測的靈敏度；

（4）高度集成化樣品制備、基因擴增、核酸標記及檢測儀器的研制和開發。

  上述問題不僅是當前和今后一段時期內國內外基因芯片技術研究的焦點，同時也是基因芯片能否從實驗室研究推向應用的關鍵問題。總之，基因芯片技術發展到今天不過短短幾年時間，雖然還存在這樣或那樣的問題，但其在基因表達譜分析、基因診斷、藥物篩選及序列分析等諸多領域已呈現出廣闊的應用前景，隨著研究的不斷深入和技術的更加完善基因芯片一定會在生命科學研究領域發揮出其非凡的作用。 從某種意義上我們可以這樣認為：基因的結構或種類決定物種；基因的功能或表達則決定生命，即生物的生、老、病、死。基因芯片技術將為
我們提供一條認識生命本質的捷徑。

    只要事先除去高度及中等重復序列，任何DNA 都可以被用于Microarray。zui簡單的例子是用機械手把極微量（nanoliters）的DNA 點到玻片或其它載體上，照射UV light 使之*固定，用不同細胞周期發育階段的cDNA 作探針系統性地研究細胞中任意時期特異表達的基因；若把某一生物體內全部全部已知基因分別點到DNA 微列陣或者基因芯片上，再用不同發育階段的cDNA 與之雜交，就能了解某些基因對特定生長發育階段的重要性；基因芯片還可用于進行基因診斷，可建立正常人特定組織、器官的基因芯片，給出標準雜交信號圖。用可疑病人的cDNA 做探針與之雜交，檢查哪些基因的表達受抑制或激活。